Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP4P49662 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP4P49662 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP4P49662 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP4P49662 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP4P49662 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP4P49662 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP4P49662 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CASP4P49662 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP4P49662 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP4P49662 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP4P49662 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP4P49662 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP4P49662 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP4P49662 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP4P49662 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP4P49662 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP4P49662 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP4P49662 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP4P49662 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP4P49662 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP4P49662 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP4P49662 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP4P49662 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP4P49662 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP4P49662 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP4P49662 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP4P49662 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP4P49662 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP4P49662 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP4P49662 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP4P49662 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP4P49662 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP4P49662 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP4P49662 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP4P49662 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP4P49662 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP4P49662 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP4P49662 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP4P49662 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP4P49662 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP4P49662 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP4P49662 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP4P49662 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP4P49662 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP4P49662 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP4P49662 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP4P49662 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP4P49662 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP4P49662 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP4P49662 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP4P49662 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP4P49662 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP4P49662 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP4P49662 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP4P49662 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP4P49662 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP4P49662 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP4P49662 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP4P49662 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP4P49662 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP4P49662 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP4P49662 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP4P49662 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP4P49662 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP4P49662 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP4P49662 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP4P49662 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP4P49662 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP4P49662 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP4P49662 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP4P49662 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP4P49662 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP4P49662 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP4P49662 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP4P49662 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP4P49662 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP4P49662 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP4P49662 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP4P49662 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP4P49662 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP4P49662 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP4P49662 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP4P49662 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP4P49662 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP4P49662 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP4P49662 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP4P49662 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP4P49662 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP4P49662 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP4P49662 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP4P49662 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP4P49662 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP4P49662 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP4P49662 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP4P49662 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP4P49662 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP4P49662 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP4P49662 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP4P49662 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms