Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms