Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms