Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms