Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL1P40616 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL1P40616 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL1P40616 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL1P40616 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL1P40616 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL1P40616 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL1P40616 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL1P40616 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL1P40616 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL1P40616 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL1P40616 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL1P40616 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL1P40616 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms