Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAL1P37235 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms