Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DSG3P32926 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG3P32926 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG3P32926 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG3P32926 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG3P32926 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG3P32926 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG3P32926 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG3P32926 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG3P32926 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG3P32926 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG3P32926 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG3P32926 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG3P32926 SDHD-204ENST00000528021 1071 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG3P32926 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG3P32926 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG3P32926 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG3P32926 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG3P32926 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG3P32926 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG3P32926 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG3P32926 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG3P32926 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG3P32926 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG3P32926 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG3P32926 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG3P32926 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG3P32926 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG3P32926 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG3P32926 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms