Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 SEC61G-202ENST00000395535 459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AL590408.1-201ENST00000430905 453 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 ZRANB2-AS2-205ENST00000455406 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 HLTF-AS1-201ENST00000492461 415 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AC073857.1-201ENST00000625082 1054 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AL390036.1-203ENST00000635340 894 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 CU633906.2-205ENST00000624847 1468 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 LINC02525-202ENST00000435043 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AL096677.1-201ENST00000442884 814 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 LNX1-AS2-202ENST00000509974 628 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC091901.1-201ENST00000517722 736 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AL121972.2-202ENST00000429386 586 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms