Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms