Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms