Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB2P29033 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB2P29033 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB2P29033 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB2P29033 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB2P29033 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB2P29033 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB2P29033 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB2P29033 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB2P29033 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB2P29033 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB2P29033 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB2P29033 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB2P29033 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB2P29033 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB2P29033 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB2P29033 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB2P29033 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB2P29033 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB2P29033 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB2P29033 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB2P29033 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB2P29033 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB2P29033 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB2P29033 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB2P29033 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB2P29033 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB2P29033 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB2P29033 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB2P29033 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB2P29033 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB2P29033 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB2P29033 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GJB2P29033 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GJB2P29033 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GJB2P29033 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GJB2P29033 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GJB2P29033 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GJB2P29033 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GJB2P29033 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GJB2P29033 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB2P29033 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB2P29033 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB2P29033 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB2P29033 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB2P29033 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB2P29033 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB2P29033 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB2P29033 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB2P29033 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms