Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms