Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms