Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms