Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME2P23368 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME2P23368 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME2P23368 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME2P23368 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME2P23368 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME2P23368 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME2P23368 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME2P23368 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME2P23368 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME2P23368 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME2P23368 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME2P23368 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME2P23368 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME2P23368 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME2P23368 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME2P23368 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME2P23368 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME2P23368 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME2P23368 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME2P23368 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME2P23368 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME2P23368 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME2P23368 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME2P23368 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME2P23368 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME2P23368 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ME2P23368 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ME2P23368 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ME2P23368 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ME2P23368 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME2P23368 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME2P23368 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME2P23368 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME2P23368 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME2P23368 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME2P23368 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME2P23368 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME2P23368 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME2P23368 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME2P23368 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME2P23368 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ME2P23368 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME2P23368 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME2P23368 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME2P23368 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME2P23368 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME2P23368 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME2P23368 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME2P23368 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME2P23368 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME2P23368 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME2P23368 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME2P23368 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME2P23368 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME2P23368 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME2P23368 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME2P23368 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME2P23368 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME2P23368 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME2P23368 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME2P23368 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME2P23368 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME2P23368 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME2P23368 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME2P23368 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME2P23368 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME2P23368 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME2P23368 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME2P23368 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME2P23368 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME2P23368 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms