Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLP19338 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLP19338 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLP19338 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLP19338 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLP19338 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLP19338 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLP19338 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLP19338 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLP19338 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLP19338 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLP19338 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLP19338 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLP19338 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLP19338 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLP19338 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLP19338 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLP19338 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLP19338 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms