Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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