Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XBP1P17861 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XBP1P17861 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XBP1P17861 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XBP1P17861 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XBP1P17861 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XBP1P17861 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XBP1P17861 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XBP1P17861 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XBP1P17861 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XBP1P17861 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XBP1P17861 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XBP1P17861 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
XBP1P17861 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XBP1P17861 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XBP1P17861 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XBP1P17861 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XBP1P17861 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XBP1P17861 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XBP1P17861 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XBP1P17861 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XBP1P17861 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
XBP1P17861 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
XBP1P17861 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XBP1P17861 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
XBP1P17861 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XBP1P17861 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XBP1P17861 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XBP1P17861 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XBP1P17861 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XBP1P17861 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XBP1P17861 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XBP1P17861 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XBP1P17861 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XBP1P17861 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XBP1P17861 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XBP1P17861 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XBP1P17861 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XBP1P17861 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XBP1P17861 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XBP1P17861 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XBP1P17861 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XBP1P17861 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
XBP1P17861 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
XBP1P17861 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
XBP1P17861 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
XBP1P17861 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XBP1P17861 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XBP1P17861 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XBP1P17861 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XBP1P17861 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XBP1P17861 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XBP1P17861 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
XBP1P17861 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XBP1P17861 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XBP1P17861 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XBP1P17861 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
XBP1P17861 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
XBP1P17861 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
XBP1P17861 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
XBP1P17861 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
XBP1P17861 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
XBP1P17861 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
XBP1P17861 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XBP1P17861 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XBP1P17861 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
XBP1P17861 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XBP1P17861 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XBP1P17861 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XBP1P17861 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XBP1P17861 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XBP1P17861 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XBP1P17861 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XBP1P17861 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
XBP1P17861 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
XBP1P17861 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XBP1P17861 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XBP1P17861 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XBP1P17861 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
XBP1P17861 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XBP1P17861 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XBP1P17861 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XBP1P17861 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XBP1P17861 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XBP1P17861 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XBP1P17861 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XBP1P17861 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XBP1P17861 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XBP1P17861 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XBP1P17861 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XBP1P17861 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XBP1P17861 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
XBP1P17861 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XBP1P17861 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms