Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EPCAMP16422 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EPCAMP16422 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EPCAMP16422 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EPCAMP16422 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms