Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms