Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CETPP11597 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CETPP11597 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CETPP11597 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CETPP11597 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CETPP11597 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CETPP11597 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CETPP11597 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CETPP11597 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CETPP11597 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CETPP11597 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CETPP11597 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CETPP11597 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CETPP11597 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CETPP11597 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CETPP11597 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CETPP11597 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CETPP11597 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CETPP11597 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CETPP11597 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CETPP11597 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CETPP11597 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CETPP11597 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CETPP11597 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CETPP11597 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CETPP11597 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CETPP11597 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CETPP11597 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CETPP11597 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CETPP11597 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CETPP11597 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CETPP11597 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CETPP11597 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CETPP11597 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CETPP11597 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CETPP11597 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CETPP11597 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CETPP11597 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CETPP11597 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CETPP11597 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CETPP11597 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CETPP11597 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CETPP11597 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CETPP11597 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CETPP11597 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CETPP11597 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CETPP11597 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CETPP11597 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CETPP11597 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CETPP11597 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CETPP11597 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CETPP11597 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CETPP11597 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CETPP11597 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CETPP11597 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CETPP11597 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CETPP11597 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CETPP11597 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CETPP11597 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CETPP11597 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CETPP11597 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms