Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP1P11387 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TOP1P11387 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TOP1P11387 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP1P11387 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP1P11387 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP1P11387 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP1P11387 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP1P11387 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP1P11387 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP1P11387 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP1P11387 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP1P11387 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP1P11387 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP1P11387 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP1P11387 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP1P11387 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP1P11387 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP1P11387 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP1P11387 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP1P11387 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TOP1P11387 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP1P11387 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP1P11387 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP1P11387 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP1P11387 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP1P11387 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP1P11387 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP1P11387 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP1P11387 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP1P11387 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP1P11387 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP1P11387 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP1P11387 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP1P11387 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP1P11387 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP1P11387 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP1P11387 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP1P11387 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP1P11387 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP1P11387 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP1P11387 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP1P11387 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP1P11387 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP1P11387 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP1P11387 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP1P11387 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP1P11387 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP1P11387 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP1P11387 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP1P11387 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP1P11387 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP1P11387 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP1P11387 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP1P11387 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP1P11387 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP1P11387 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP1P11387 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP1P11387 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP1P11387 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP1P11387 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP1P11387 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP1P11387 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP1P11387 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP1P11387 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP1P11387 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP1P11387 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP1P11387 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP1P11387 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP1P11387 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP1P11387 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP1P11387 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP1P11387 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP1P11387 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms