Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms