Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00032P0C843 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms