Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms