Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NGFRP08138 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NGFRP08138 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NGFRP08138 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NGFRP08138 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NGFRP08138 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NGFRP08138 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NGFRP08138 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NGFRP08138 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NGFRP08138 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NGFRP08138 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NGFRP08138 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NGFRP08138 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NGFRP08138 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NGFRP08138 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NGFRP08138 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NGFRP08138 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NGFRP08138 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NGFRP08138 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NGFRP08138 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NGFRP08138 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NGFRP08138 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NGFRP08138 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NGFRP08138 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NGFRP08138 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NGFRP08138 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NGFRP08138 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NGFRP08138 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NGFRP08138 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NGFRP08138 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NGFRP08138 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NGFRP08138 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NGFRP08138 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NGFRP08138 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NGFRP08138 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NGFRP08138 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NGFRP08138 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NGFRP08138 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NGFRP08138 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms