Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGAVP06756 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGAVP06756 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGAVP06756 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGAVP06756 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGAVP06756 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGAVP06756 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGAVP06756 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGAVP06756 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGAVP06756 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGAVP06756 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGAVP06756 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGAVP06756 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGAVP06756 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGAVP06756 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms