Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 276.8 ms