Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms