Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ZNF253O75346 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZNF253O75346 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZNF253O75346 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZNF253O75346 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZNF253O75346 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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ZNF253O75346 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF253O75346 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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ZNF253O75346 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF253O75346 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF253O75346 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF253O75346 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF253O75346 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF253O75346 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF253O75346 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF253O75346 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF253O75346 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF253O75346 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF253O75346 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF253O75346 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF253O75346 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF253O75346 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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