Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms