Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms