Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTIFO43310 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTIFO43310 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTIFO43310 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CTIFO43310 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTIFO43310 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTIFO43310 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTIFO43310 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTIFO43310 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTIFO43310 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTIFO43310 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTIFO43310 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTIFO43310 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTIFO43310 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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