Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms