Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASKO14936 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASKO14936 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASKO14936 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASKO14936 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASKO14936 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASKO14936 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASKO14936 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASKO14936 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASKO14936 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASKO14936 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASKO14936 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASKO14936 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASKO14936 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASKO14936 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASKO14936 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASKO14936 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASKO14936 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASKO14936 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASKO14936 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASKO14936 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASKO14936 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASKO14936 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASKO14936 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASKO14936 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASKO14936 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CASKO14936 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASKO14936 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASKO14936 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASKO14936 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASKO14936 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms