Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCKDKO14874 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms