Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN34H7C241 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN34H7C241 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms