Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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