Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DGG1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DGG1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DGG1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DGG1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DGG1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DGG1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DGG1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DGG1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DGG1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DGG1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DGG1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DGG1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DGG1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DGG1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DGG1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DGG1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DGG1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DGG1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DGG1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DGG1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DGG1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DGG1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DGG1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DGG1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
B4DGG1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DGG1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DGG1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DGG1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DGG1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DGG1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DGG1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DGG1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DGG1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DGG1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DGG1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DGG1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DGG1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DGG1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DGG1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DGG1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DGG1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DGG1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DGG1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms