Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms