Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms