Protein–RNA interactions for Protein: W5XKT8

SPACA6, Sperm acrosome membrane-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA6W5XKT8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPACA6W5XKT8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPACA6W5XKT8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPACA6W5XKT8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPACA6W5XKT8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPACA6W5XKT8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPACA6W5XKT8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPACA6W5XKT8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPACA6W5XKT8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPACA6W5XKT8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPACA6W5XKT8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPACA6W5XKT8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPACA6W5XKT8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPACA6W5XKT8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPACA6W5XKT8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPACA6W5XKT8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SPACA6W5XKT8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPACA6W5XKT8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SPACA6W5XKT8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPACA6W5XKT8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPACA6W5XKT8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPACA6W5XKT8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPACA6W5XKT8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPACA6W5XKT8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPACA6W5XKT8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPACA6W5XKT8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPACA6W5XKT8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPACA6W5XKT8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPACA6W5XKT8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPACA6W5XKT8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPACA6W5XKT8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPACA6W5XKT8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPACA6W5XKT8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPACA6W5XKT8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPACA6W5XKT8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPACA6W5XKT8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPACA6W5XKT8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPACA6W5XKT8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 468.9 ms