Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NCOA3Q9Y6Q9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NCOA3Q9Y6Q9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NCOA3Q9Y6Q9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NCOA3Q9Y6Q9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NCOA3Q9Y6Q9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NCOA3Q9Y6Q9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NCOA3Q9Y6Q9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NCOA3Q9Y6Q9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NCOA3Q9Y6Q9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NCOA3Q9Y6Q9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NCOA3Q9Y6Q9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NCOA3Q9Y6Q9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NCOA3Q9Y6Q9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NCOA3Q9Y6Q9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NCOA3Q9Y6Q9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NCOA3Q9Y6Q9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NCOA3Q9Y6Q9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NCOA3Q9Y6Q9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
NCOA3Q9Y6Q9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NCOA3Q9Y6Q9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NCOA3Q9Y6Q9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NCOA3Q9Y6Q9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NCOA3Q9Y6Q9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
NCOA3Q9Y6Q9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
NCOA3Q9Y6Q9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NCOA3Q9Y6Q9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NCOA3Q9Y6Q9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NCOA3Q9Y6Q9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NCOA3Q9Y6Q9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NCOA3Q9Y6Q9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NCOA3Q9Y6Q9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NCOA3Q9Y6Q9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
NCOA3Q9Y6Q9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NCOA3Q9Y6Q9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
NCOA3Q9Y6Q9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NCOA3Q9Y6Q9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NCOA3Q9Y6Q9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NCOA3Q9Y6Q9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NCOA3Q9Y6Q9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NCOA3Q9Y6Q9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
NCOA3Q9Y6Q9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
NCOA3Q9Y6Q9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
NCOA3Q9Y6Q9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
NCOA3Q9Y6Q9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
NCOA3Q9Y6Q9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
NCOA3Q9Y6Q9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NCOA3Q9Y6Q9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NCOA3Q9Y6Q9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NCOA3Q9Y6Q9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NCOA3Q9Y6Q9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NCOA3Q9Y6Q9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NCOA3Q9Y6Q9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NCOA3Q9Y6Q9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NCOA3Q9Y6Q9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NCOA3Q9Y6Q9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
NCOA3Q9Y6Q9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NCOA3Q9Y6Q9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NCOA3Q9Y6Q9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NCOA3Q9Y6Q9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NCOA3Q9Y6Q9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NCOA3Q9Y6Q9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NCOA3Q9Y6Q9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NCOA3Q9Y6Q9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NCOA3Q9Y6Q9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NCOA3Q9Y6Q9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
NCOA3Q9Y6Q9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
NCOA3Q9Y6Q9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NCOA3Q9Y6Q9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NCOA3Q9Y6Q9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
NCOA3Q9Y6Q9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
NCOA3Q9Y6Q9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NCOA3Q9Y6Q9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NCOA3Q9Y6Q9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
NCOA3Q9Y6Q9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NCOA3Q9Y6Q9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NCOA3Q9Y6Q9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NCOA3Q9Y6Q9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NCOA3Q9Y6Q9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
NCOA3Q9Y6Q9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NCOA3Q9Y6Q9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NCOA3Q9Y6Q9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NCOA3Q9Y6Q9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NCOA3Q9Y6Q9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NCOA3Q9Y6Q9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
NCOA3Q9Y6Q9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NCOA3Q9Y6Q9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NCOA3Q9Y6Q9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
NCOA3Q9Y6Q9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NCOA3Q9Y6Q9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
NCOA3Q9Y6Q9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NCOA3Q9Y6Q9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NCOA3Q9Y6Q9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
NCOA3Q9Y6Q9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NCOA3Q9Y6Q9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NCOA3Q9Y6Q9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NCOA3Q9Y6Q9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms