Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT3AQ9Y6K1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DNMT3AQ9Y6K1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNMT3AQ9Y6K1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT3AQ9Y6K1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms