Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNX11Q9Y5W9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX11Q9Y5W9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX11Q9Y5W9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX11Q9Y5W9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX11Q9Y5W9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX11Q9Y5W9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX11Q9Y5W9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX11Q9Y5W9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX11Q9Y5W9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX11Q9Y5W9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms