Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5H0

PCDHGA3, Protocadherin gamma-A3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA3Q9Y5H0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHGA3Q9Y5H0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHGA3Q9Y5H0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHGA3Q9Y5H0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHGA3Q9Y5H0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHGA3Q9Y5H0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHGA3Q9Y5H0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHGA3Q9Y5H0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHGA3Q9Y5H0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHGA3Q9Y5H0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms