Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHB5Q9Y5E4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHB5Q9Y5E4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHB5Q9Y5E4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHB5Q9Y5E4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHB5Q9Y5E4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCDHB5Q9Y5E4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHB5Q9Y5E4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHB5Q9Y5E4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHB5Q9Y5E4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHB5Q9Y5E4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHB5Q9Y5E4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHB5Q9Y5E4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHB5Q9Y5E4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHB5Q9Y5E4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHB5Q9Y5E4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHB5Q9Y5E4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHB5Q9Y5E4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHB5Q9Y5E4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHB5Q9Y5E4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHB5Q9Y5E4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHB5Q9Y5E4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHB5Q9Y5E4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHB5Q9Y5E4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHB5Q9Y5E4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHB5Q9Y5E4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHB5Q9Y5E4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHB5Q9Y5E4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDHB5Q9Y5E4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDHB5Q9Y5E4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PCDHB5Q9Y5E4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB5Q9Y5E4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB5Q9Y5E4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB5Q9Y5E4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB5Q9Y5E4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB5Q9Y5E4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB5Q9Y5E4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB5Q9Y5E4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB5Q9Y5E4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB5Q9Y5E4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB5Q9Y5E4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB5Q9Y5E4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB5Q9Y5E4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB5Q9Y5E4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB5Q9Y5E4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHB5Q9Y5E4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms