Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFE2L3Q9Y4A8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFE2L3Q9Y4A8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NFE2L3Q9Y4A8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFE2L3Q9Y4A8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFE2L3Q9Y4A8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFE2L3Q9Y4A8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFE2L3Q9Y4A8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFE2L3Q9Y4A8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFE2L3Q9Y4A8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
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NFE2L3Q9Y4A8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFE2L3Q9Y4A8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
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NFE2L3Q9Y4A8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
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NFE2L3Q9Y4A8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
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NFE2L3Q9Y4A8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFE2L3Q9Y4A8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFE2L3Q9Y4A8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
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NFE2L3Q9Y4A8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
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NFE2L3Q9Y4A8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFE2L3Q9Y4A8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFE2L3Q9Y4A8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFE2L3Q9Y4A8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
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NFE2L3Q9Y4A8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFE2L3Q9Y4A8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NFE2L3Q9Y4A8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
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NFE2L3Q9Y4A8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFE2L3Q9Y4A8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFE2L3Q9Y4A8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFE2L3Q9Y4A8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFE2L3Q9Y4A8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFE2L3Q9Y4A8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFE2L3Q9Y4A8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFE2L3Q9Y4A8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFE2L3Q9Y4A8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFE2L3Q9Y4A8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFE2L3Q9Y4A8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFE2L3Q9Y4A8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFE2L3Q9Y4A8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFE2L3Q9Y4A8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFE2L3Q9Y4A8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFE2L3Q9Y4A8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFE2L3Q9Y4A8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFE2L3Q9Y4A8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
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