Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZDHHC9Q9Y397 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZDHHC9Q9Y397 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZDHHC9Q9Y397 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZDHHC9Q9Y397 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZDHHC9Q9Y397 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZDHHC9Q9Y397 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZDHHC9Q9Y397 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZDHHC9Q9Y397 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZDHHC9Q9Y397 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZDHHC9Q9Y397 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZDHHC9Q9Y397 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZDHHC9Q9Y397 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZDHHC9Q9Y397 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZDHHC9Q9Y397 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZDHHC9Q9Y397 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZDHHC9Q9Y397 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZDHHC9Q9Y397 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZDHHC9Q9Y397 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZDHHC9Q9Y397 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZDHHC9Q9Y397 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZDHHC9Q9Y397 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZDHHC9Q9Y397 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZDHHC9Q9Y397 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZDHHC9Q9Y397 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZDHHC9Q9Y397 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZDHHC9Q9Y397 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZDHHC9Q9Y397 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZDHHC9Q9Y397 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZDHHC9Q9Y397 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZDHHC9Q9Y397 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ZDHHC9Q9Y397 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZDHHC9Q9Y397 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZDHHC9Q9Y397 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZDHHC9Q9Y397 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZDHHC9Q9Y397 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZDHHC9Q9Y397 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZDHHC9Q9Y397 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZDHHC9Q9Y397 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZDHHC9Q9Y397 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZDHHC9Q9Y397 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ZDHHC9Q9Y397 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZDHHC9Q9Y397 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZDHHC9Q9Y397 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZDHHC9Q9Y397 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ZDHHC9Q9Y397 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZDHHC9Q9Y397 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZDHHC9Q9Y397 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZDHHC9Q9Y397 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZDHHC9Q9Y397 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZDHHC9Q9Y397 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZDHHC9Q9Y397 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZDHHC9Q9Y397 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZDHHC9Q9Y397 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZDHHC9Q9Y397 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZDHHC9Q9Y397 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZDHHC9Q9Y397 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZDHHC9Q9Y397 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZDHHC9Q9Y397 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZDHHC9Q9Y397 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZDHHC9Q9Y397 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ZDHHC9Q9Y397 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZDHHC9Q9Y397 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZDHHC9Q9Y397 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZDHHC9Q9Y397 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZDHHC9Q9Y397 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZDHHC9Q9Y397 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZDHHC9Q9Y397 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZDHHC9Q9Y397 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms