Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED16Q9Y2X0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED16Q9Y2X0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED16Q9Y2X0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED16Q9Y2X0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED16Q9Y2X0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MED16Q9Y2X0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED16Q9Y2X0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED16Q9Y2X0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED16Q9Y2X0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED16Q9Y2X0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED16Q9Y2X0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED16Q9Y2X0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED16Q9Y2X0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED16Q9Y2X0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED16Q9Y2X0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED16Q9Y2X0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED16Q9Y2X0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED16Q9Y2X0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED16Q9Y2X0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED16Q9Y2X0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MED16Q9Y2X0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MED16Q9Y2X0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MED16Q9Y2X0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MED16Q9Y2X0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MED16Q9Y2X0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MED16Q9Y2X0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms